Update Dockerfile

iwatobipen · Sep 13, 2024 · cf2cab8 · cf2cab8
1 parent d32cb74
commit cf2cab8
Showing 1 changed file with 20 additions and 20 deletions.
diff --git a/Dockerfile b/Dockerfile
@@ -10,25 +10,25 @@ RUN apt-get update && apt-get install -y \
     flex
 RUN wget https://sw-tools.rcsb.org/apps/MAXIT/maxit-v11.200-prod-src.tar.gz
 RUN tar zxvf maxit-v11.200-prod-src.tar.gz
-RUN cd maxit-v11.200-prod-src
-# MAXIT_INSTALL_DIRをRCSBROOTとして固定するためのハック
-RUN sed -i -e "s|char\* rcsbroot = getenv(\"RCSBROOT\");|const char\* rcsbroot = \"$MAXIT_INSTALL_DIR\";|" maxit-v10.1/src/maxit.C
-RUN sed -i -e "s|char\* rcsbroot = getenv(\"RCSBROOT\");|const char\* rcsbroot = \"$MAXIT_INSTALL_DIR\";|" maxit-v10.1/src/process_entry.C
-RUN sed -i -e "s|char\* rcsbroot = getenv(\"RCSBROOT\");|const char\* rcsbroot = \"$MAXIT_INSTALL_DIR\";|" maxit-v10.1/src/generate_assembly_cif_file.C
-# コンパイル（必ず並列数は1にする。並列コンパイルは失敗する。）
-RUN make binary -j1
-# インストール
-RUN mkdir -p $MAXIT_INSTALL_DIR
-RUN mv bin data $MAXIT_INSTALL_DIR
-# インストールしたユーザー以外のアカウントから使いたい場合はパーミッションを適切に設定する
-# 初期状態では他のユーザーアカウントからは実行できない
-RUN chmod 755 $MAXIT_INSTALL_DIR/data
-RUN chmod 755 $MAXIT_INSTALL_DIR/data/binary
-RUN chmod 755 $MAXIT_INSTALL_DIR/data/ascii
-RUN chmod 644 $MAXIT_INSTALL_DIR/data/binary/*
-RUN chmod 644 $MAXIT_INSTALL_DIR/data/ascii/*
-RUN wget https://files.rcsb.org/download/3QUG.pdb
-RUN $MAXIT_INSTALL_DIR/bin/maxit -input 3QUG.pdb -output 3qug.cif -o 1 -log maxit.log
-RUN head 3qug.cif
+RUN cd maxit-v11.200-prod-src && \
+  # MAXIT_INSTALL_DIRをRCSBROOTとして固定するためのハック
+  sed -i -e "s|char\* rcsbroot = getenv(\"RCSBROOT\");|const char\* rcsbroot = \"$MAXIT_INSTALL_DIR\";|" maxit-v10.1/src/maxit.C  && \
+  sed -i -e "s|char\* rcsbroot = getenv(\"RCSBROOT\");|const char\* rcsbroot = \"$MAXIT_INSTALL_DIR\";|" maxit-v10.1/src/process_entry.C  && \
+  sed -i -e "s|char\* rcsbroot = getenv(\"RCSBROOT\");|const char\* rcsbroot = \"$MAXIT_INSTALL_DIR\";|" maxit-v10.1/src/generate_assembly_cif_file.C  && \
+  # コンパイル（必ず並列数は1にする。並列コンパイルは失敗する。）
+  make binary -j1 && \
+  # インストール
+  mkdir -p $MAXIT_INSTALL_DIR && \
+  mv bin data $MAXIT_INSTALL_DIR && \
+  # インストールしたユーザー以外のアカウントから使いたい場合はパーミッションを適切に設定する
+  # 初期状態では他のユーザーアカウントからは実行できない
+  chmod 755 $MAXIT_INSTALL_DIR/data && \
+  chmod 755 $MAXIT_INSTALL_DIR/data/binary && \
+  chmod 755 $MAXIT_INSTALL_DIR/data/ascii && \
+  chmod 644 $MAXIT_INSTALL_DIR/data/binary/* && \
+  chmod 644 $MAXIT_INSTALL_DIR/data/ascii/* && \
+  wget https://files.rcsb.org/download/3QUG.pdb && \
+  $MAXIT_INSTALL_DIR/bin/maxit -input 3QUG.pdb -output 3qug.cif -o 1 -log maxit.log && \
+  head 3qug.cif
 
 WORKDIR /opt