Error in rcell2.cellid::cell.load.alt(path = data.dir)

[clementejose]

Luego de correr cellID exitosamente intento cargar los datos utilizando la función
rcell2.cellid::cell.load.alt(path = path.img)

Obtengo la salida

Error in load_out_all(path = path, position.pattern = position.pattern, : Error in load_out_all: number of flags does not match extracted channel names. Check your 'fluorescence.pattern'

Sindo que, si utilizo la vieja función para cargar el mismo objeto rcell2::load_cell_data(path=path.img), se ejecuta sin errores.

Los canales de adquisición son (TFP, YFP, BF)

[naikymen]

Hola José, cómo estás?

Desde ya muchas gracias por repotar el error.

El error implica que el output de cell-id tiene cierta cantidad de flags (e.g. 0,1) pero las imágenes que querés cargar están nombradas con otra cantidad de canales (e.g. TFP, YFP, BF).

Habría que chequear si cell-id efectivamente usó todos los canales, o si falta alguno.

Mandame por si acaso un archivo out_bf_fl_mapping, de cualquier posición.

Si no, podés usar Python.

TKM